曹洞宗の寺院で、1233年（天福元）道元禅師が禅道場として深草に開創されました。旧勢力の圧迫で福井に拠点を移したため廃れましたが、1648（慶安元）淀城主永井尚政により永井家の菩提寺としてこの地に再興されました。　淀藩は伏見城が廃城された後、山城唯一の城として京都を守るとともに、尚政は後水尾天皇に輿入れした徳川和子と、兄徳川家光の架け橋でもありました。本尊釈迦牟尼仏は開祖道元の作で、本堂は、伏見城の遺構と伝えられます。鴬張りの廊下と、落城時の将兵の血のりの手形、足形が残る天井などがあります。宇治川沿いの石門から龍宮門に続く参道琴坂は、新緑、紅葉の名所として多くの人が訪れます。